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Bacillus F の研究コーパス:菌株の発見、ゲノム寄託、国際特許ファミリー、コメットアッセイの証拠、そして特許文書——すべてここで公開しています。

発見と菌株

2009年、ヤクーチアのマンモス山で掘削された永久凍土コアから、推定300万年の休眠を経て培養下で蘇った細菌が見つかりました。この菌株——非公式に Bacillus F と名付けられた——は、微生物学、ゲノミクス、老年学にまたがる研究プログラムの対象となりました。

興味深いのは年齢そのものではなくメカニズムです。それほど長く生き延びるには、酸化ダメージへの並外れた防御が必要です——まさに私たちのポストバイオティクス製剤が届けるべく作られた機構です。物語版はストーリーページでどうぞ。

アナトリ・ブロチコフ教授
アナトリ・ブロチコフ教授
モスクワ大学地質凍土学科長——Bacillus F 研究プログラムを主導
彼の物語 →
生命体そのものではなく、その「牢獄」を年代測定します。マンモス山の永久凍土層は成層した堆積物で、その年代は古地磁気学的・生層序学的手法で確定されます。層の中に封じられた細菌が、層そのものより若いことはあり得ません。批判者が掘削時の汚染リスクを指摘するのはもっともで、だからこそコアは無菌の内部からサンプリングされ、分離は再現されました。菌株の頑健で解読済みのゲノムは、現代の汚染物ではなく長期休眠と整合しています。

ゲノムと特許

ゲノムは解読・寄託され、菌株とその応用は国際特許ファミリーで保護されています。以下の各項目は公式登録簿にリンクしています。

WO2012060729: Bacillus sp. 菌株とその応用国際(WIPO)RU + EP: 国内移行出願特許2件US + JP + CN: 国内移行出願特許3件ゲノム寄託: 解読済みゲノム、公的リポジトリ受入番号参照

コメットアッセイの証拠

単一細胞ゲル電気泳動——コメットアッセイ——はDNAの断片化を直接可視化します。損傷したDNAは彗星の尾のように核から流れ出します。スライダーをドラッグして、未処理の細胞と、in vitro で Bacillus F ポストバイオティクスに曝露した細胞を比較してください。

コメットアッセイ:DNA断片化の尾を引く未処理の細胞
コメットアッセイ:核が無傷の処理済み細胞
⇔
未処理
+ Bacillus F

特許文書

公開済み特許のスキャン。クリックするとフル解像度のスキャンが開きます。

特許 WO2012060729
特許 WO2012060729
特許ファミリーのスキャン
特許ファミリーのスキャン
細胞をスライド上のアガロースに包埋し、溶解してDNAだけを残し、電場に置きます。無傷のDNAは大きすぎて動けません。断片化したDNAは陽極へ移動し、「彗星の尾」を形成します。尾の長さと強度が細胞ごとのDNA損傷を定量します。参照実験では、酸化ストレッサーに曝された細胞は、Bacillus F ポストバイオティクスで前処理された場合、劇的に短い尾を示しました——上でドラッグできるビフォー/アフターがそれです。

顕微鏡写真とレンダー

研究プログラムによる菌株の顕微鏡画像——原子間力顕微鏡、電子顕微鏡、位相差顕微鏡。

Bacillus F 菌株の顕微鏡写真
Bacillus F 細胞の走査型電子顕微鏡写真
Bacillus F の培養画像

エビデンスに関する質問

国際出願は WO2012060729(「Bacillus sp. 菌株およびその応用」)で、WIPO 経由で出願され、同じファミリーの国内特許5件(RU 2413760, RU 2752140, UA 96709, UA 101781, UA 102047)があります。各件は本ページの「ゲノムと特許」節に登録参照とともに掲載しています。

年代測定の対象は微生物そのものではなく、それを封じ込めた永久凍土層です。マンモス山(ヤクーチア)の堆積層は古地磁気法と生層序法で年代決定され、コア内部の無菌部分から採取された細菌はその層より新しくはあり得ません。そこから約300万年という推定が導かれます。

単一細胞ゲル電気泳動は、細胞ごとのDNA断片化を測定します。細胞をアガロース中で溶解し電場に置くと、無傷のDNAは大きすぎて移動せず、断片化したDNAが陽極へ移動して「コメットの尾」を形成します。尾の長さと強度が損傷量を定量します。

特許WO2012060729のスキャンと各国特許ファミリーのスキャン、そしてコメットアッセイ画像です。すべて原寸解像度で開き、スキャンの代わりに要約を置くことはしていません。

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